庫車大清真寺是信奉伊斯蘭教的人民群眾做禮拜的宗教場所。大寺坐落在新疆新疆維吾爾自治區阿克蘇地區庫車市黑墩巴扎最高處。距庫車新城4公里，是新疆境內僅次于喀什艾提尕清真寺的第二大寺。庫車大寺據傳為16世紀新疆伊斯蘭教黑山派首領伊斯哈格吾里從喀什到庫車留居傳道期間所建。最初是土建寺院，17世紀改為木結構，1923年遇大火被燒毀，現存寺院為1931年建成。
大寺門樓高18.3米，全部青磚砌成，高聳的門樓與宣禮塔，莊嚴挺拔。塔柱雕以伊斯蘭風格圖案，穹窿式樓頂，形似天宇，寺內禮拜大廳1500平方米，可容納3000人大禮拜。
縱橫8行的64根六棱形大柱，飾似彩雕繪畫，支撐起由102塊方格畫圖案組成的天花板，華麗壯觀,值得一提的是小清真寺之北有一處聲威顯赫的“宗教法庭”，它是政教合一的產物，也是新疆保留的為數不多的伊斯蘭教司法機構遺址。
伊斯蘭教在庫車傳播后，約在15世紀營建此宗教建筑， 初始為土建寺院，17世紀改作木結構寺院。1923年重修后遇大火焚毀。現存寺院為1931年建成，在80年代曾予個繕。
原庫車大清真寺于1918年遭火災被焚，1923年由當地阿吉（名叫艾里木）主持集資、募捐重建了這座清真寺。1927年竣工。寺院面積1165平方米，主體建筑有兩部分，一是大寺院主體，內有旋轉樓梯至寺頂，供阿喊“乃瑪孜”之有。全為磚木結構。二是供信徒禮拜時使用的大殿。大殿分前廳和后室兩部分，面積約65平方米。在寺內庭院東南角保留了一處伊斯蘭宗教法庭的遺址。
