祖印寺位于浙江省舟山市城區中心，系舟山市重點文物保護單位。據志書記載，該寺原址在衢山島，舊名“蓬萊院”，創建于后晉天福五年(940年)，迄今已有千年歷史。宋治平年間賜今額，改名“祖印”。嘉熙年間，邑令余桂遷寺至今址，與原普陀山接待寺合并。元至元年間，高僧山寧開法祖印，繼有密庵禪師住持該寺，弘揚禪宗佛法，聲譽鵲起，香火鼎盛。祖印寺曾數毀數興：明初廢縣毀寺，香火中斷；宣德年間重建，正統年間又遭火焚；成化年間再重建。清初，島民內遷，城垣盡毀，寺院殿宇亦毀于兵燹，四周房舍無存瓦片寸椽，惟大雄寶殿巍然不動，時人傳為神異。康熙年間定海總鎮蘭理募資修復；同治年間住持僧云岫禪師又募資擴建；宣統年間邑人朱葆三捐資再重修。現存山門、天王殿、大雄寶殿、后大殿、鐘樓、東西廂房計有面積二千三百平方米，占地五千多平方米。除正山間系近年重建外，其余皆為清朝建筑。
1950年5月，寺宇一度用作國家糧庫。雖佛事中斷，但寺院幸存。1986年，政府耗資近50萬元，遷糧庫，修殿宇，寺貌重現，改作市博物館。1994年，政府又遷博物館，從而恢復寺院佛像，重開佛事活動。當年6月，禮請寧波阿育王寺74歲高齡化通法師來寺住持。歷經三年艱苦整修，寺院建筑煥然一新。十八羅漢，五百羅漢、文殊、普賢、地藏、觀音、彌勒、韋馱等新塑像巍峨莊嚴，栩栩如生。最有特色的文物和佛教藝術品，一是象徵著香火日盛的鎮寺之寶——祖印寶鼎，高達3.4米，重1.5噸；二是1995年從緬甸迎請來的玉觀音坐像，高2.2米，重2噸多，玉質精細優良，雕刻工藝精美，形態端莊大方，現供奉于后大殿；三是大雄寶殿的建筑藝術和塑像。大雄寶殿高17.5米，達深19米，寬29.6米。總面積564平方米，重檐歇山頂，上檐九彩斗拱，五架抬梁，建筑藝術高超精致。殿內主供三世佛像。正中供奉釋迦牟尼佛，左右有迦葉尊者、阿難尊者護持。東西兩側沿壁塑有十八羅漢像和五百羅漢像。
在當地政府鼎力相助下，今日祖印寺，古風重振，法炬復然，釋音續傳，誦經禮佛，香煙繚繞，晨鐘暮鼓，又震海山。
